מיום הקמתה פועלת יד הנדיב מתוך אמונה שמצוינות אנושית היא כוח מניע לשינוי עמוק ומתמשך בישראל, וכי טיפוח מצוינות צריך להתרחש כפועל יוצא של אחריות משותפת ושאיפה להרחבת הזדמנויות. הפרסים והמלגות שמעניקה הקרן הם ביטוי מובהק למחויבות זו, לצד וכחלק בלתי נפרד מפעילותה השוטפת וארוכת הטווח. מטרת הפרסים היא להכיר בהישגים יוצאי דופן במדע, באמנויות ובחינוך ולהוקיר את המחוללים של הישגים אלה; והמלגות מעניקות לחוקרים צעירים מצטיינים מרחב ואפשרות להתמסר למחקר, להעמיק ולקדם את המדעים המדויקים והעיוניים בישראל ובעולם. בכך מבקשת יד הנדיב להעלות על נס הישגים קיימים, ובד בבד לאפשר ולקדם פריצות דרך עתידיות, מתוך תפיסה שידע ומנהיגות שנבנים כאן יתרמו לעתיד טוב יותר לכלל תושבי ישראל, יחזקו שוויון הזדמנויות, ירחיבו את מעגלי ההשפעה הציבורית של המחקר והעשייה, ויעודדו מחויבות מתמשכת לטובת הכלל.